清凉店站历史悠久，可以追溯到日本侵华时期。据说当时石德铁路本来应该穿过团村坟地，因该村有人给日本人当翻译，为了保住自家风水，往北挪了一点就到了清凉店村，于是这个站也就叫了清凉店站。最初是单线，后来增加为复线。
一个故事是位于尧头村北的一座铁路桥在97年前后改造时依然用的是日军修建的桥墩，施工队想用炸药炸掉重修，结果爆破完毕，桥墩丝毫无损，于是作罢，继续使用至今。
清凉店站的一纸A4公告显示，该站已于2010年9月1日停止客运业务。
坐北朝南的清凉店站
停止客运业务的公告
上了锁的出站口大门
空荡荡的候车大厅
站前广场的存车铺
全景照